目前所職掌之污染防治業務有污水處理廠、化學實驗室廢水處理設備(已停用)、有害 廢棄物暫存設施、放流水水質檢驗、飲用水水質檢驗等項目。
污水處理廠
本校污水處理廠於民國九十年完工啟用迄今，共秏資一千餘萬元，採接觸氧化法處理全校生活污水。
目前每日處理水量約280CMD，依照水污染防治法規定，本校需設置乙級廢污水處理專責人員一位，現由本組組長吳慶龍先生擔任，並依照規定須每半年申報操作及水質檢驗紀錄乙次。
化學實驗室廢水處理設備(已停用)
本校原設有化學實驗室廢水處理設備設置於卓民樓頂樓，採化學混凝法處理化學實驗室所產生之廢水。
但因五專部廢除，化學實驗課大幅縮減，造成處理水量接近為0，目前已將廢水處理設備辦理停用程序，往後產生之廢水將改以廢液方式委外處理，以符經濟效益。
放流水水質檢驗
為確實監測污水處理場放流水質是否符合現行標準，每月由放流水池採樣並自主檢驗下列項目：大腸桿菌類、生化需氧量(BOD)、化學需氧量(COD)、縣浮固體濃度(SS)、PH值、水溫。
有害廢棄物暫存設施
本校有害廢棄物暫存設施設置於卓民樓一樓，專門貯存酸鹼廢液、廢棄藥品、混凝劑、助凝劑等，其數量累積至一定數額時即委託合格廠商負責清理。
另因貯存之物品具腐蝕性、易燃性、毒性，故其內部之燈光照明均採防爆型，並設有24小時抽排氣設備、緊急淋浴設備、消防安全設備，以防止意外發生。
飲水機水質檢驗
本校目前設置之飲水機數量約為80台，分布於校內各建築物，平時之維護保養由總務處營繕組負責，水質之檢驗由本組負責，檢驗時間每三個月乙次，依現行法令規定採抽測驗方式進行，抽測數量為總數殘之八分之一，檢驗項目有大腸桿菌及總菌落數兩項，檢驗結果定期公告於本組網站上，供全校師生參考，若檢驗不合格者將由本組通知總務處營繕組即刻改善，未改善前須將該飲水機停用，直至改善複驗合格為止。
